ماده 44 ـ به منظور توسعه و ترویج مبانی و موازین حقوق شهروندی در زندان ها بازداشتگاهها و موسسه های تحت نظر سازمان رعایت موازین حقوق اسلامی و انسانی تسهیل روند زندان زدایی و بازسازگاری محکومان با جامعه دفتری به نام « دفتر حمایت از حقوق شهروندی زندانیان» زیر نظر رییس سازمان و با تعداد لازم کارشناس تشکیل می شود.

وظایف این دفتر به شرح زیر است:
1 ـ مطالعه بررسی و پیگیری موارد نقض حقوق شهروندی در زندان‎ها بازداشتگاهها و مراکزحرفه‎آموزی و اشتغال و اعلام آن به رئیس سازمان؛
2 ـ مطالعه پرونده‎های قضایی افراد تحت قرار و تذکر گذشت موعدهای قانونی به قاضیان ناظر و مقام‎های قضایی مربوط؛
3 ـ تهیه کتابچه‎ای در مورد حقوق و تکالیف قانونی محکومان و متهمان و تفهیم ماهانه این حقوق و تکالیف به افراد تازه وارد؛
4 ـ همکاری مستمر و نظام‎مند با هیات نظارت براجرای قانون احترام به آزادیهای مشروع و حفظ حقوق شهروندی ستاد حقوق بشر قوه قضاییه و سایر نهادهای حقوق بشری پس از هماهنگی با رییس سازمان؛
5 ـ نظارت برحسن اجرای این آیین‎نامه و سایر اموری که به این دفتر به موجب قانون ارجاع می‎شود.
تبصره 1 ـ مسوول دفتر از میان حقوقدانان آگاه به موازین حقوق شهروندی توسط رئیس سازمان انتخاب می‎شود.
تبصره 2 ـ مسئوول دفتر موظف است از وضعیت حقوق شهروندی مراکز حرفه‎آموزی و اشتغال و زندان‎ها بطور ماهیانه به رییس سازمان گزارش دهد.
تبصره 3 ـ گزارش سالیانه حقوق شهروندی سازمان بوسیله مسئوول دفتر تهیه گشته ازطریق رییس سازمان تسلیم رییس قوه‎قضاییه خواهد شد.
تبصره 4 ـ در کلیه اداره‎های کل استانی واحد حمایت از حقوق شهروندی زندانیان تاسیس خواهدشد.