ماده 39ـ به منظور نظارت بر اتاقهای تعاون وزارت از اختیارات زیر برخوردار است:

1ـ بررسی پیشنهادهای مربوط به تشکیل اتاقهای تعاون استانها و شهرستانها جهت تایید ضرورت و یا اعلام کتبی رد با ذکر علت موضوع ماده (57) قانون.
2ـ بررسی پیشنهادهای مربوط به اساسنامه ها و آیین نامه های اتاقهای تعاون جهت تصویب نهایی وزیر تعاون موضوع بند «الف» تبصره (1) ماده (59) قانون.
3ـ بررسی مدارک مربوط به تشکیل اتاقهای تعاون اساسنامه ها نام اعضای مجمع نمایندگان اعضای اتاقها هیئت مدیره هیئت بازرسی صاحبان امضای مجاز و تغییرات آنها جهت تطبیق با مقررات و ثبت در وزارت و انتشار موارد ثبت شده در روزنامه رسمی کشور.
4ـ تعیین یک عضو از هیئت بازرسی هر اتاق تعاون برای انجام وظایف موضوع ماده (63) قانون.
5 ـ اخذ و بررسی گزارشهای سالانه نوبتی و موردی واصل شده از هر یک از بازرسان و هیئت بازرسی هر اتاق تعاون و انجام اقدامات لازم.
6 ـ اخذ و بررسی گزارش عـملکرد و صورت های مـالی و در صورت لزوم انجام حسابرسی.
7ـ اخطار توقف عملیات خلاف مقررات و دستور اصلاح آن.
8 ـ اعلام موارد تخلف به مراجع ذی ربط و طرح شکایت در مراجع قضایی.
9ـ اخطار در خصوص لزوم تطبیق اساسنامه و آیین نامه های داخلی با مقررات مربوط.
تبصره 1ـ نحوه ارائه گزارشهای مالی و عملکرد اتاقهای تعاون و حسابرسی آنها مطابق دستورالعمل تبصره (1) ماده (36) این آیین نامه خواهد بود.
تبصره 2ـ نظارت بر انتخابات اتاقهای تعاون طبق فصل چهارم این آیین نامه صورت می گیرد.