به موجب بند الف ماده 65 قانون احکام دائمی برنامه­های توسعه کشور مصوب 10/11/1395 «مدیران سازمان­های مناطق آزاد به نمایندگی از طرف دولت بالاترین مقام منطقه محسوب می­شوند و کلیه وظایف اختیارات و مسئولیت­های دستگاه­های اجرایی دولتی مستقر در این مناطق به استثنای نهادهای دفاعی و امنیتی به عهده آن­ها است. سازمان­های مناطق آزاد منحصرا بر اساس قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری- صنعتی و اصلاحات بعدی آن و قانون کار اداره می­شوند». طبق بند الف ماده 27 ماده واحده قانون اصلاح قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری- صنعتی جمهوری اسلامی ایران مصوب 22/8/1375 «به منظور ایجاد هماهنگی در فعالیت­های مناطق آزاد حسب مورد با تایید وزیر ذی­ربط دستگاه­های اجرایی وابسته به قوه مجریه اختیارات خود را به رئیس هیئت مدیره و مدیرعامل سازمان­های مناطق آزاد تفویض نمایند» در اجرای مصوبه موظف نمودن سازمان­های مناطق آزاد تجاری- صنعتی به حفظ کاربری اراضی کشاورزی در محدوده مناطق مذکور مورخ 14/4/96 هیئت وزیران «سازمان­های مناطق آزاد تجاری- صنعتی موظف به حفظ کاربری اراضی کشاورزی در محدوده مناطق مذکور شده­اند». وفق ماده 5 آئین­نامه نحوه استفاده از زمین و منابع ملی در مناطق آزاد تجاری- صنعتی جمهوری اسلامی ایران مصوب 23/12/1372 هیئت وزیران «کلیه حقوق مربوط به اراضی مشمول قانون زمین شهری و قانون ملی شدن جنگل­ها و مراتع کشور و نیز قانون حفاظت و بهره­برداری از جنگل­ها و مراتع کشور و قانون اراضی مستحدث و ساحلی واقع در محدوده هر منطقه به موجب این آیین­نامه از طریق سازمان مناطق آزاد تجاری- صنعتی همان منطقه اعمال می­شود». حسب ماده 7 آئین­نامه مرقوم «کلیه دیون و حقوق و تکالیف سازمان ملی زمین و مسکن و سازمان جنگل­ها و مراتع و واحدهایی که شمول این مقررات مستلزم ذکر نام آن­هاست در امور اراضی منابع طبیعی در هر 1398/01/28    3221/97/7 شماره پرونده:  97-192-3221 ع   منطقه به عهده سازمان مناطق آزاد تجاری- صنعتی همان منطقه محول شده است» و طبق ماده 15 همان آئین­نامه «کلیه اختیاراتی که در رابطه با تجاوز و تصرف و تخریب اراضی دولتی و ملی و اراضی ساحلی و حریم آن بر اساس قانون حفاظت و بهره­برداری از جنگل­ها و مراتع کشور مصوب 1348 و اصلاحات بعدی آن و قانون اراضی مستحدث و ساحلی مصوب 1354 به وزارتخانه­های مسئول محول شده و هم­چنین اختیارات موضوع مواد 11 تا 15 قانون حفاظت و بهسازی محیط زیست مصوب 1353 که به سازمان حفاظت محیط زیست تفویض شده است و نیز اختیارات خاصی که در این مورد به سایر نهادهای دولتی محول گردیده است از تاریخ تصویب آئین­نامه مارالذکر (23/12/1372) به سازمان مناطق آزاد تجاری- صنعتی تفویض شده است». طبق دادنامه شماره 9709970906010223 مورخ 25/7/97 هیئت تخصصی اراضی و شهرسازی دیوان عدالت اداری مواد 5 7 و 15 آئین­نامه فوق­الذکر خلاف قانون تشخیص داده نشده است؛ بنابراین اعلام شکایت سازمان مناطق آزاد تجاری- صنعتی در رابطه با جرم تغییر غیرمجاز کاربری اراضی زراعی و باغ­ها به جهات فوق­الذکر وجاهت قانونی دارد. مدیرعامل سازمان مناطق آزاد تجاری- صنعتی به عنوان یکی از اعضای کمیسیون تبصره 1 ماده 1 قانون حفظ کاربری اراضی زراعی و باغ­ها مصوب 31/3/1374 با اصلاحات بعدی و نیز کمیسیون تقویم و ارزیابی اراضی موضوع تبصره 3 الحاقی به ماده 2 قانون مزبور می­تواند در جلسات کمیسیون موصوف شرکت کند و در باب تغییر کاربری تقویم و ارزیابی اراضی زراعی و باغ­ها موضوع قانون موصوف اظهارنظر نماید یا نماینده خود را جهت شرکت در جلسات کمیسیون­های پیش گفته معرفی نماید. نحوه تقویم مانند سایر نقاط کشور می­باشد.